Bir kimyasal olarak dezenfektanlar depolanma yerlerinde özel dikkat gerektirir. Genel olarak dezenfektanlar iyi-havalandırılan, kuru, doğrudan güneş ışığından ve çocukların erişemeyeceği bir yerde (depo, dolap veya kutu gibi serin ve kuru bir yerde) saklanmalıdır. Ayrıca kazara yutulmasını veya kötüye kullanılmasını önlemek için yiyecek ve içeceklerden uzak tutulmalıdır. Dezenfektan sıvı ise sızıntıyı önlemek için ağzı kapalı bir kapta saklanmalıdır. Depolama sırasında kazaları önlemek için diğer kimyasallardan ayrı tutulmalıdır.
